Para desinstalar um serviço do Windows abra o Prompt de Comando como Administrador, digite o comando abaixo e tecle ENTER:

sc delete NomeDoServiço

O nome do serviço pode ser obtido nas propriedades do serviço via Painel de controle > Ferramentas administrativas > Serviços ou executando o comando sc queryex type=service state=all no Prompt de Comando.

Observação: Este comando não apaga os arquivos do serviço em questão.